ContigExpress(序列拼接结果验证工具)下载

分类:其他行业 软件版本:v3.0.0 绿色版 大小:1.0M 更新日期:2024年11月15日
本站评级:★★★★☆ 语言:简体中文 授权版本:免费 运行环境:Windows 11,Windows 10,Windows 8,Windows 7

ContigExpress(序列拼接结果验证工具) v3.0.0 绿色版


ContigExpress是一款功能专业的测序结果的序列拼接经常用的软件,是可以帮助生物研究的朋友们更加方便的测量序列.有需要的朋友就来万能驱动网下载吧!

经常用的软件简介

由于一般测序方法的限制,测续结果一般只能到800bp左右,所以对于较长片段只能用不同引物测序后根据结果拼接,ContigExpress正是一款功能很实用的序列拼接经常用的软件。

应用于方法

解压缩下载的压缩文件contig.zip文件,保证文件CExpress.exe,Gexudat.def在同一个目录下,打开Cexpress.exe应用程序,进入ContigExpress操作界面

ContigExpress

点击菜单上的“project”选择“Add Fragments”,一般我们发给您的是AB1文件,如果您有其它格式的文件,也可以选择,在这里我们选择AB1文件,以其为例

ContigExpress

选择您存放AB1文件(即我们Email给您的测序结果的彩图文件)的目录,选择文件类型为ALL FILES, 之后打开要拼接的AB1,从而添加进ContigExpress经常用的软件。在此以A、B两个序列为例,如果有多个序列的也可以同时添加进入。

ContigExpress

选中要拼接的序列,再选菜单 “Assemble”栏下的“Assemble Selected Fragments”命令,或用工具栏上的按钮,如图3。若两个结果能够拼接起来的,会得到一个Assemble1下的contig1的结果

ContigExpress

双击contig1,打开拼接后的结果,选中菜单“VIEW”栏,进入VIEW OPTION,将SHOW ALIGNMENT AS 由 TEXT 改为 GRAPH.,点击OK后得到结果如图5。此时可能会因为两条序列的测序结果误差,会有不同的地方,在拼接图片框中的绿色竖杠就表示了这些不同的地方。接着可点击绿色竖杠找到有误差的地方,进行修改。

ContigExpress

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软件下载信息清单:


软件名称 发布日期 文件大小 下载文件名
ContigExpress(序列拼接结果验证工具)安装包 2024年11月15日 1.0M ContigExpress.zip
下载地址:
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